Der Vorstandsbereich des GFZ untergliedert sich in den wissenschaftlichen Vorstandsbereich und den administrativen Vorstandsbereich. 

Der wissenschaftliche Vorstandsbereich koordiniert und kommuniziert an den Schnittstellen zwischen Vorstand, Verwaltung, Wissenschaft innerhalb und außerhalb des Zentrums, Helmholtz-Gemeinschaft, Ministerien und Behörden sowie weiteren Stakeholdern und Öffentlichkeit.

Die Mitarbeitenden des wissenschaftlichen Vorstandsbereichs unterstützen Vorstand, Gremien und Beschäftigte des GFZ bei folgenden Aufgaben: Strategische Entwicklung, Wissens- und Technologietransfer, nationale und internationale Kooperationen, institutionelle Mitgliedschaften, Drittmittel, Berufungsmanagement, Presse- und Öffentlichkeitsarbeit, wissenschaftliches Controlling und Berichtswesen, Nachhaltigkeit, Schnittstelle zu politischen Akteur:innen, wissenschaftliche Infrastrukturen und Synergiepotenziale.

Die einzelnen Einheiten des wissenschaftlichen Vorstandsbereichs sind: Operatives Management | Transfer & Innovation | Helmholtz-Angelegenheiten | Synergien & Netzwerke | Strategische Themen | Projekte & Internationales | Kommunikation & Medien

Die Leitungen dieser Einheiten bilden zusammen das Team der wissenschaftlichen Vorständin (Team WV). Das Team WV unterstützt und berät die Vorständin und ist ansprechbar für die oben genannten Aufgaben.

Der Administrative Vorstandsbereich unterstützt den Vorstand bei der Wahrnehmung seiner Aufgaben. Er umfasst folgende Geschäftsbereiche: Rechtsabteilung I Verwaltungs-IT I Strategisches Controlling

Daneben sind dem für die Administration verantwortlichen Vorstandsmitglied in direkter Berichtslinie folgende Bereiche zugeordnet: Innenrevision | Stabsstelle Compliance | Datenschutz | Exportkontrolle | Arbeitssicherheit