Helmholtz-Zentrum Deutsches Geoforschungszentrum

Dr. Alexander Bartholomäus

Wissenschaftler
Dr. Alexander Bartholomäus
Haus A 71, Raum 355 (Büro - Techniker/in)
Telegrafenberg
14473 Potsdam

Funktion und Aufgaben:

Bioinformatische Analyse und Auswertung von Next-Generation Sequencing (NGS) Datensätzen um Wechselwirkung mikrobieller Gemeinschaften mit der Umwelt zu erforschen:

  • (Meta) Genomics-/Transcriptomics Analysen
  • Integration von Metadaten
  • Pipeline erstellen und optimieren
  • App (R/Shiny) Entwicklung

Wissenschaftliche Interessen:

  • Genregulation and -kontrolle
  • Mikrobielle Gemeinschaften
  • Next-Generation Sequencing (NGS)
  • (Meta) Genomics
  • (Meta) Transcriptomics
  • Umfängliche genetische Analysen
  • RNA Sekundärstruktur
  • Translation & Ribosom
  • Digital image processing (RGB und Hyperspektral)
  • Data visualisierung
  • R-programmierung / Shiny (WebApps)

Werdegang / Ausbildung:

seit 2019 PostDoc am GFZ

2018-2019 Data Scientist und Webentwickler bei Ferchau GmbH

2016-2018 Bioinformatiker bei Targenomix GmbH (Research&Development)

2016 PhD in Bioinformatik (Universität Hamburg / Universität Potsdam)

2012 Master of Science in Bioinformatik (Universität Potsdam)

2010 Bachelor of Science in Molekular- und Zellbiologie (Universität Potsdam)

Projekte:

Aktuelle Projekte:

@Researchgate

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